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Laboratorio de Bioinformatica

Responsable: Ing. Horacio Arricobene

 

Integrantes

Dra. Paola Ferrero; Lic. Ezequiel Paulucci

Objetivo General

El objetivo principal del Laboratorio es la aplicación y desarrollo de los sistemas computacionales para la obtención, almacenamiento y análisis de la información Biológica.


Desarrollo y aplicación de Algoritmos Biológicos para analizar el Flujo de información por Micro-ARN.

Objetivo

Estudiar y desarrollar modelos no convencionales que permitan interpretar los diferentes mecanismos de regulación de Flujo de Información biológica por micro-ARN, aplicando técnicas de ingeniería en comunicación y algoritmos computacionales.

Resumen Técnico.

El Dogma Central de la Biología Molecular nos provee un marco de referencia para entender el flujo de información genética, (ADN -> ARN -> Proteína). La decodificación de diversos genomas eucariontes nos indica que solo una fracción menor del ADN es trascripto.
Más aun, una enorme cantidad de información ni siquiera puede ser comprendida con los paradigmas regulatorios actuales.
Uno de los mecanismos descubiertos recientemente -año 2003- es el de regulación por micro_ARNs, estos micro genes controlan el flujo de información biológica mediante la regulación del ARNm a través de su trascripción a proteína y de un complejo mecanismo de identificación (ARN_m - micro_ARN). En busca de nuevas formas de entender este mecanismo regulatorio se desarrollarán y simularán modelos no convencionales aplicando técnicas de ingeniería comunicacional y algoritmos computacionales.

 

 

Explorar la Aplicación de la Teoría de Códigos en el análisis Comunicacional de los sistemas Biológicos.

Objetivo

Obtener un modelo comunicacional que amplié y/o mejore el conocimiento sobre la transmisión de información Biológica a través de códigos de alto rendimiento que se opongan a la acción contaminante del Ruido Genético.
Resumen Técnico.

- Introducción

La biología de los cuerpos vivos ha sido señalada -por diversos autores- como un sistema de comunicaciones que intercambia permanentemente información biológica entre los distintos sistemas y aun dentro de cada sistema, a los efectos de mantener las capacidades de crecimiento, reproducción y reemplazo o sea, sus capacidades vitales funcionado correctamente.
Es probable que en esta transmisión de la información biológica sean aplicados códigos para disminuir la probabilidad de error y tener capacidades de corrección de aquellos errores que inexorablemente son causados por acción del ruido geneático.
Basándose en este modelo estamos interesados en analizar las redundancias como control del error en la transmisión de la información almacenada en el DNA teniendo como antecedentes la aplicación de los códigos convolucionales y de auto-correlación como camino del menor Error.